据介绍，科技部主要从以下４个方面改革科技计划管理：围绕落实《国家中长期科学和技术发展规划纲要（２００６－２０２０年）》的目标任务，优化科技工作的布局，建立由重大专项和基本计划组成的国家科技计划体系，形成和完善与各项科技计划相适应的管理制度和运行机制。

以促进科技计划管理的公平、公正、公开、高效为核心，建立行为规范、运转协调、公正透明、廉洁高效的科技计划管理新模式。主要包括建立国家科技计划信息管理平台，科技计划全面实行网上申报，积极推行科技项目网上评审，建立科技计划组织实施信息公开公示制度；科技计划项目评审、评估、论证专家组的遴选，全面实行随机抽取机制，并同步推进专家信用管理和回避制度。

围绕建立和完善科技计划管理监督制约机制。制定了加强科技计划管理与健全监督机制的意见，规范计划管理各个环节的职责和任务；引入第三方评估监理机制，加强对计划实施绩效和管理绩效的考评。

围绕加强科技计划的宏观管理，积极推进科技计划管理职能的转变。科技管理部门将把注意力更多放在加强统筹协调、提供支撑服务、强化执行监管和创造有利环境等方面，减少对项目的直接管理。项目的组织实施将更多地发挥行业部门和地方科技管理部门的作用。