目前，深圳海关不断完善电子口岸管理机制及整体服务体系，电子口岸实现了一个窗口统一受理申请、一个窗口统一取件，大大提高了办事效率。
联手电信建造数据中心
深圳海关负责人告诉记者，该关运用中国电信丰富的网络资源，加强与中国电信共建电子口岸数据中心和信息服务平台。深圳海关与中国电信深圳分公司合作，积极开展深圳电子口岸IDC项目建设。充分利用中国电信丰富的公众通信网络资源，快速形成全面覆盖深圳关区电子口岸用户的网络服务平台，为统一的物流通关公共信息服务平台提供了可靠的网络支撑。同时，利用电信级IDC基础设施，建立深圳电子口岸应用系统专用区域，为电子口岸各项业务应用系统提供了卓越的运行环境。
由于依托IDC托管运营模式，成功实施了深港绿色通道、盐田港保税物流园区等多个网络信息应用系统，极大提升了深圳关区进出口快捷通关的能力。目前，已经开通深圳电子口岸门户网站,积极推进了一个"门户"入网、一种认证登录和"一站式"办事。